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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MineICA。

分析ICA分解获得的基因组数据

Bioconductor版本:2.12

MineICA的目标是使简单的解释解释分解通过独立分量分析的转录组数据。它有助于组件通过研究它们的生物学解释与变量(e。g示例注释)和基因集,使组件的比较从不同的数据集使用correlation-based图。

作者:安妮Biton

维护人员:安妮Biton <安妮。在gmail.com biton >

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PDF	R脚本	MineICA:独立分量分析的基因组数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),Biobase,plyr,ggplot2,尺度,foreach,xtable,biomaRt,gtools,GOstats,集群,marray,mclust,RColorBrewer,色彩,igraph,Rgraphviz,图,注释,Hmisc,fastICA,玉、方法
进口	AnnotationDbi,光民,fpc,lumiHumanAll.db
链接
建议	biomaRt,GOstats,集群,hgu133a.db,mclust,igraph,breastCancerMAINZ,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,breastCancerVDX
SystemRequirements
增强了	doMC
URL
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建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	MineICA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	MineICA_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	MineICA_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/mineica/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MineICA/
包下载报告	下载数据