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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅KEGGgraph。

KEGGgraph:图方法在R和Bioconductor KEGG通路

Bioconductor版本:2.12

KEGGGraph KEGG通路之间的接口和图形对象以及一组工具来分析,剖析这些图形和可视化。它解析定期更新KGML (KEGG XML)文件到图模型属性维护所有必要的途径。包提供的功能包括解析、图形操作、可视化等。

作者:大卫Jitao张

维修工:Jitao大卫张< jitao_david。张在roche.com >

安装

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文档

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browseVignettes (“KEGGgraph”)

PDF	R脚本	KEGGgraph:应用实例
PDF	R脚本	KEGGgraph: KEGG通路图方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GraphsAndNetworks,NetworkVisualization,通路,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(7年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.10),方法,XML(2.3 > = 0),图
进口	方法,XML,图
链接
建议	Rgraphviz,RBGL,RUnit,RColorBrewer,KEGG.db,org.Hs.eg.db,hgu133plus2.db,SPIA
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.nextbiomotif.com
取决于我	pathview,ROntoTools,SPIA
进口我	限幅器,DEGraph,NCIgraph
建议我	DEGraph
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	KEGGgraph_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGgraph_1.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	KEGGgraph_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/kegggraph/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGgraph/
包下载报告	下载数据