要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htseqgenie”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

htseqgenie

该软件包适用于生物导体的2.12版;对于稳定的最新版本,请参阅htseqgenie

NGS分析管道。

生物导体版本:2.12

进行NGS分析的库。

作者:Gregoire Pau,Jens Reeder

维护者:Gene.com上的Gregoire Pau

引用(从r内,输入引用(“ htseqgenie”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htseqgenie”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ htseqgenie”)

PDF R脚本 GMAPR
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 软件
版本 3.10.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(3。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.15.0),Shortread(> = 1.14.4),并行,HWRITER,,,,开罗, 工具,rtracklayer,,,,GMAPR(> = 1.1.10)
进口 生物基因(> = 0.2.0),iranges(> = 1.14.3),基因组机(> = 1.7.12),rsamtools(> = 1.8.5),生物弦(> = 2.24.1),chipseq(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.17.19),GenomicFeatures(> = 1.9.31),变体工具(> = 1.1.16),变体(> = 1.5.41)
链接
建议 txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,GenomicFeatures,,,,肺部,,,,org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 htseqgenie_3.10.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/htseqgenie/tree/release-2.12
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/htseqgenie/
软件包下载报告 下载统计

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