要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htseqgenie”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的2.12版;对于稳定的最新版本,请参阅htseqgenie。
生物导体版本:2.12
进行NGS分析的库。
作者:Gregoire Pau,Jens Reeder
维护者:Gene.com上的Gregoire Pau
引用(从r内,输入引用(“ htseqgenie”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ htseqgenie”)
R脚本 | GMAPR | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 软件 |
版本 | 3.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(3。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.15.0),Shortread(> = 1.14.4),并行,HWRITER,,,,开罗, 工具,rtracklayer,,,,GMAPR(> = 1.1.10) |
进口 | 生物基因(> = 0.2.0),iranges(> = 1.14.3),基因组机(> = 1.7.12),rsamtools(> = 1.8.5),生物弦(> = 2.24.1),chipseq(> = 1.6.1),rtracklayer(> = 1.17.19),GenomicFeatures(> = 1.9.31),变体工具(> = 1.1.16),变体(> = 1.5.41) |
链接 | |
建议 | txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,GenomicFeatures,,,,肺部,,,,org.hs.eg.db |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | htseqgenie_3.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/htseqgenie/tree/release-2.12 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/htseqgenie/ |
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