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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅基因组机。

基因组间隔的表示和操纵

生物导体版本：2.12

在分析高通量测序数据（又称NGS数据）时，有效存储基因组注释和比对的能力正在发挥核心作用。该软件包定义了用于存储基因组间隔的通用容器以及更专业的容器，以存储针对参考基因组的比对。

作者：P。Aboyoun，H。Pages和M. Lawrence

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

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Browsevignettes（“基因组旋翼”）

PDF		基因组介绍
PDF	R脚本	Genomicranges用例
PDF	R脚本	重叠编码
PDF	R脚本	总结概述
PDF		SumparizeOverLaps-modes.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，遗传学，，，，高通量序列，，，，测序，，，，软件
版本	1.12.5
在生物导体中	Bioc 2.6（R-2.11）（6年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.10），方法，生物基因（> = 0.5.4），iranges（> = 1.17.33）
进口	方法，utils，stats，生物基因，，，，iranges
链接	iranges
建议	AnnotationDbi（> = 1.21.1），生物弦（> = 2.25.3），rsamtools（> = 1.11.24），BSGENOME，，，，rtracklayer，，，，GenomicFeatures，，，，变体，，，，EDGER，，，，deseq，，，，dexseq，，，，Eatonetalchipseq（> = 0.0.3），Leebamviews，，，，帕西拉，，，，pasillabamsubset，，，，org.sc.sgd.db，，，，txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene，，，，seqnames.db，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2，，，，bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3，，，，运行，，，，消化
系统要求
增强
URL
取决于我	Annmap，，，，Biomvrcns，，，，Biseq，，，，BSGENOME，，，，BSSEQ，，，，Bumphunter，，，，卡斯珀，，，，Cheung2010，，，，嵌合体，，，，chipseq，，，，CN. -ops，，，，CSAR，，，，达西尔，，，，Deepsnv，，，，deseq2，，，，差异，，，，Dream4，，，，DSQTL，，，，EasyRnaseq，，，，Eatonetalchipseq，，，，ememblvep，，，，Epgenomix，，，，外观复制，，，，fastseg，，，，基因组，，，，GenomicFeatures，，，，Genoset，，，，ggtools，，，，ggtut，，，，GMAPR，，，，Gwascat，，，，HITC，，，，htseqtools，，，，Illuminahumanmethylation450kprobe，，，，Minfi，，，，MMDIFF，，，，甲状旁腺，，，，ping，，，，准，，，，R3CSEQ，，，，rcade，，，，repitools，，，，Ripseeker，，，，rsamtools，，，，rsffreader，，，，RSVSIM，，，，rtracklayer，，，，片段，，，，seqbias，，，，Shortread，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20090506，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.2011119，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608，，，，SOMATICA，，，，剪接图，，，，transview，，，，变体，，，，变体工具
进口我	AnnotationHub，，，，arrayexpresshts，，，，Biovizbase，，，，Biseq，，，，卡格，，，，chipseq，，，，chipseqr，，，，库务，，，，deseq2，，，，dexseq，，，，Epgenomix，，，，funcisnp，，，，GenomicFeatures，，，，Genoset，，，，GGBIO，，，，GMAPR，，，，GVIZ，，，，htseqgenie，，，，htsfilter，，，，Leebamviews，，，，Medips，，，，甲基分析，，，，甲基赛克，，，，最小值，，，，MMDIFF，，，，狭窄，，，，核，，，，寡群，，，，图片，，，，Prebs，，，，准，，，，repitools，，，，RNASEQMAP，，，，rsamtools，，，，rsffreader，，，，rtracklayer，，，，片段，，，，Shortread，，，，Snpchip，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20090506，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.2011119，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608，，，，SOMATICA，，，，剪接图，，，，三元，，，，香草，，，，变体工具，，，，波动
建议我	Beadarrayusecases，，，，生物基因，，，，iranges，，，，甲基菌，，，，幻影，，，，狭窄，，，，repitools，，，，rnaseqtutorial
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	genomicranges_1.12.5.tar.gz
Windows二进制	genomicranges_1.12.5.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	Genomicranges_1.12.5.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/genomicranges/tree/release-2.12
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genomicranges/
软件包下载报告	下载统计