安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GenomeGraphs”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

GenomeGraphs

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomeGraphs

从运用绘制基因组信息

Bioconductor版本:2.12

基因组数据分析需要综合可视化已知的基因组信息和新的实验数据。GenomeGraphs使用biomaRt包现场表演注释查询来运用和翻译这如基因/记录结构网格图形视窗的包。这导致基因组信息一起绘制数据。GenomeGraphs的另一个优点是绘制不同的数据类型,如全息阵列基因表达,测序和其他数据,一起在一个阴谋使用相同的基因组坐标系统。

作者:史蒂芬Durinck < sdurinck gmail.com >,布拉德布拉德< berkeley.edu >

维护人员:史蒂芬Durinck < sdurinck gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GenomeGraphs”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GenomeGraphs”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenomeGraphs”)

PDF R脚本 GenomeGraphs用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列,软件,可视化
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 2.2 (r - 2.7)(8年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 2.10),方法,biomaRt、网格
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 Genominator,waveTiling
进口我
建议我 leeBamViews,oneChannelGUI,rMAT,三层
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GenomeGraphs_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 GenomeGraphs_1.20.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GenomeGraphs_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/genomegraphs/tree/release - 2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomeGraphs/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
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