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GWASTools
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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GWASTools。
全基因组关联研究的工具
Bioconductor版本:2.12
类来存储很大的GWAS的数据集和注释,对GWAS数据清洗和分析和功能。
作者:斯蒂芬妮·m·Gogarten凯茜劳丽,印度央行Bhangale,马修·p·Conomos Cecelia劳丽,凯特琳麦克休,伊恩画家,Xiuwen郑,杰西沈,罗希特Swarnkar
维护人员:斯蒂芬妮·m·Gogarten < sdmorris u.washington.edu >
从内部引用(R,回车引用(“GWASTools”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GWASTools”)
文档
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browseVignettes (“GWASTools”)
| R脚本 | 用于GWASTools VCF转换数据 | |
| R脚本 | 数据格式在GWASTools | |
| R脚本 | GWAS数据清理 | |
| R脚本 | Affymetrix准备数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneticVariability,微阵列,质量控制,单核苷酸多态性,软件 |
| 版本 | 1.6.5 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | Biobasencdf gdsfmt,三明治 |
| 进口 | 方法,DBI,RSQLite,GWASExactHW,DNAcopy,生存,航空航天,quantsmooth |
| 链接 | |
| 建议 | GWASdata,BiocGenerics,RUnitSNPRelate,snpStats,VariantAnnotation |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | GWASdata |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | GWASTools_1.6.5.tar.gz |
| Windows二进制 | GWASTools_1.6.5.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GWASTools_1.6.5.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/gwastools/tree/release - 2.12 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GWASTools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
