要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSEABase”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GSEABase.
Bioconductor版本:2.12
这个包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。
作者:马丁·摩根,赛斯·法尔肯,罗伯特·绅士
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“GSEABase”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSEABase”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GSEABase”)
R脚本 | GSEABase简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,基础设施,软件 |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),注释、方法、图(> = 1.37.2) |
进口 | BiocGenerics,注释,AnnotationDbi,Biobase,图、方法、XML |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db,GO.db,org.Hs.eg.db,Rgraphviz,ReportingTools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | AGDEX,BicARE,gCMAP,GSVA,GSVAdata,承诺 |
进口我 | 类别,categoryCompare,cellHTS2,gCMAPWeb,GSRI,GSVA,HTSanalyzeR,PCpheno,phenoTest,承诺,ReportingTools |
建议我 | BiocCaseStudies,categoryCompare,计,GlobalAncova,globaltest,GOstats,GSEAlm,PGSEA,phenoTest |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GSEABase_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | GSEABase_1.22.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GSEABase_1.22.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GSEABase/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GSEABase/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |