要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSEABase”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GSEABase

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GSEABase

基因集富集数据结构与方法

Bioconductor版本:2.12

这个包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。

作者:马丁·摩根,赛斯·法尔肯,罗伯特·绅士

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“GSEABase”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSEABase”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GSEABase”)

PDF R脚本 GSEABase简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学基础设施软件
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),注释、方法、(> = 1.37.2)
进口 BiocGenerics注释AnnotationDbiBiobase、方法、XML
链接
建议 hgu95av2.dbGO.dborg.Hs.eg.dbRgraphvizReportingTools
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 AGDEXBicAREgCMAPGSVAGSVAdata承诺
进口我 类别categoryComparecellHTS2gCMAPWebGSRIGSVAHTSanalyzeRPCphenophenoTest承诺ReportingTools
建议我 BiocCaseStudiescategoryCompareGlobalAncovaglobaltestGOstatsGSEAlmPGSEAphenoTest
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GSEABase_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 GSEABase_1.22.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GSEABase_1.22.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GSEABase/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSEABase/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心