要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOstats”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOstats.
Bioconductor版本:2.12
一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本操作工具的图形,假设检验和其他简单的计算。
作者:R. Gentleman和S. Falcon
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“GOstats”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOstats”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GOstats”)
不常见模式生物的超几何试验 | ||
R脚本 | 使用GOstats的超几何测试 | |
R脚本 | 使用GOstats可视化数据 | |
参考手册 |
biocViews | 注释,生物信息学,去,MultipleComparisons,软件 |
版本 | 2.26.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),图 |
进口 | AnnotationDbi(> = 0.0.89),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),GO.db(> = 1.13.0),RBGL,注释(> = 1.13.2),图(>= 1.15.15),方法,统计,AnnotationForge |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有,GO.db(> = 1.13.0),注释,乘,genefilter,RColorBrewer,Rgraphviz,xtable,SparseM,GSEABase,geneplotter,org.Hs.eg.db,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | 吸引,MineICA |
进口我 | affycoretools,吸引,categoryCompare,ReportingTools |
建议我 | BiocCaseStudies,类别,eisa,GSEAlm,HTSanalyzeR,MineICA,中长期规划,MmPalateMiRNA,oneChannelGUI,phenoDist,安全 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GOstats_2.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOstats_2.26.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GOstats_2.26.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GOstats/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOstats/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |