安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOSemSim。
Bioconductor版本:2.12
蕾斯尼克提出的五个方法实现,Schlicker江,林和王分别估算语义相似之处。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,狗,鸡,黑猩猩,Coelicolor,大肠杆菌菌株K12的酒井法子,飞翔,人类,疟疾,鼠,猪,猴,鼠,蠕虫,非洲爪蟾蜍,酵母,斑马鱼。
作者:Guangchuang余
维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“GOSemSim”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GOSemSim”)
R脚本 | 介绍GOSemSim | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,去,NetworkAnalysis,通路,软件 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(7年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 2.10),Rcpp |
进口 | 方法,AnnotationDbi,GO.db,org.Hs.eg.db |
链接 | Rcpp |
建议 | 剂量,clusterProfiler,BiocInstaller |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/26/7/976.full |
取决于我 | |
进口我 | 剂量 |
建议我 | clusterProfiler,ReactomePA |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GOSemSim_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOSemSim_1.18.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GOSemSim_1.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/gosemsim/tree/release - 2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/ |
包下载报告 | 下载数据 |