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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)

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GGtools

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGtools

软件和数据分析基因表达的基因

Bioconductor版本:2.12

软件和数据分析的遗传基因的表达和/或DNA甲基化

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“GGtools”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)

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browseVignettes (“GGtools”)

PDF R脚本 2012年GGtools: eQTL发现的有效工具
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本 4.8.0
Bioconductor自 BioC 1.9 (r - 2.4)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.14), stats4,GGBase(> = 3.19.7),IRanges,GenomicRanges,Rsamtools
进口 方法,跑龙套,统计数据,BiocGenerics,snpStats,ff,AnnotationDbi,Biobase,,VariantAnnotation
链接
建议 GGdata,illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608
SystemRequirements
增强了 MatrixEQTL
URL
取决于我 ceu1kg,cgdv17,cheung2010,encoDnaseI,ggtut
进口我 ceuhm3
建议我 hmyriB36,ind1KG
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GGtools_4.8.0.tar.gz
Windows二进制 GGtools_4.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GGtools_4.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/ggtools/tree/release - 2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
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