安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGtools。
Bioconductor版本:2.12
软件和数据分析的遗传基因的表达和/或DNA甲基化
作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >
维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“GGtools”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GGtools”)
R脚本 | 2012年GGtools: eQTL发现的有效工具 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 4.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.9 (r - 2.4)(9.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.14), stats4,GGBase(> = 3.19.7),IRanges,GenomicRanges,Rsamtools |
进口 | 方法,跑龙套,统计数据,BiocGenerics,snpStats,ff,AnnotationDbi,Biobase,位,VariantAnnotation |
链接 | |
建议 | GGdata,illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608 |
SystemRequirements | |
增强了 | MatrixEQTL |
URL | |
取决于我 | ceu1kg,cgdv17,cheung2010,encoDnaseI,ggtut |
进口我 | ceuhm3 |
建议我 | hmyriB36,ind1KG |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GGtools_4.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | GGtools_4.8.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GGtools_4.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/ggtools/tree/release - 2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/ |
包下载报告 | 下载数据 |