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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ deseq2”）
在大多数情况下，您根本不需要下载包装存档。
deseq2
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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅deseq2。
基于负二项式分布的差异基因表达分析
生物导体版本：2.12
估计来自高通量测序测定法的计数数据中的差异均值依赖性，并基于模型使用负二项式分布测试差异表达
作者：迈克尔·洛夫（MPIMG柏林），西蒙·安德斯，沃尔夫冈·胡伯（Embl Heidelberg）
维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）
引用（从r内，输入引用（“ deseq2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ deseq2”）
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ deseq2”）
| R脚本 | 用“ DESEQ2”软件包分析RNA-Seq数据 | |
| vst.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，差异性，，，，高通量序列，，，，rnaseq，，，，智者，，，，软件 |
| 版本 | 1.0.19 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（3年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | 基因组机，，，，iranges，，，，生物酶，，，，格子，，，，RCPP（> = 0.10.1），rcpparmadillo（> = 0.3.4.4） |
| 进口 | 基因组机，，，，iranges，，，，生物酶，，，，Locfit，，，，GeneFilter， 方法，rcolorbrewer，，，，格子 |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo |
| 建议 | 甲状旁腺，，，，帕西拉（> = 0.2.10），VSN，，，，GPLOTS |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | htsfilter |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | deseq2_1.0.19.tar.gz |
| Windows二进制 | deseq2_1.0.19.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | deseq2_1.0.19.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/deseq2/tree/release-2.12 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/deseq2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
