安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChIPXpress”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChIPXpress。
Bioconductor版本:2.12
ChIPXpress采取作为输入预测ChIPx TF结合基因数据和使用相应的基因表达谱数据库从NCBI地理下载排名TF绑定目标的基因最有可能功能特遣部队的目标。
作者:乔治·吴
维护人员:乔治·吴< gewu jhsph.edu >
从内部引用(R,回车引用(“ChIPXpress”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChIPXpress”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ChIPXpress”)
R脚本 | ChIPXpress | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,ChIPchip,ChIPseq,软件 |
版本 | 1.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.10),ChIPXpressData |
进口 | Biobase,GEOquery,frma,affy,bigmemory,biganalytics |
链接 | |
建议 | mouse4302frmavecs,mouse4302.db,mouse4302cdf,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | ChIPXpress_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ChIPXpress_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/chipxpress/tree/release - 2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPXpress/ |
包下载报告 | 下载数据 |