安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChIPXpress”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

ChIPXpress

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChIPXpress

ChIPXpress:增强目标基因转录因子识别从ChIP-seq ChIP-chip使用公开的基因表达谱数据

Bioconductor版本:2.12

ChIPXpress采取作为输入预测ChIPx TF结合基因数据和使用相应的基因表达谱数据库从NCBI地理下载排名TF绑定目标的基因最有可能功能特遣部队的目标。

作者:乔治·吴

维护人员:乔治·吴< gewu jhsph.edu >

从内部引用(R,回车引用(“ChIPXpress”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ChIPXpress”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ChIPXpress”)

PDF R脚本 ChIPXpress
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学,ChIPchip,ChIPseq,软件
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.10),ChIPXpressData
进口 Biobase,GEOquery,frma,affy,bigmemory,biganalytics
链接
建议 mouse4302frmavecs,mouse4302.db,mouse4302cdf,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 ChIPXpress_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) ChIPXpress_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/chipxpress/tree/release - 2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPXpress/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
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