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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅CSAR。

用于分析芯片序列数据的统计工具

生物导体版本：2.12

CHIP-SEQ数据分析的统计工具。该软件包包括Kaufmann等人中描述的统计方法。（2009）PLOS生物学：7（4）：E1000090。简而言之，该软件计算出基因组单核苷酸读取值的平均DNA片段大小。归一化后，使用基于泊松分布的测试比较样品和对照。测试统计阈值控制错误的发现率是通过随机排列获得的。

作者：Jose M Muino

维护者：Jose M Muino

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// URL不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ csar”）

文档

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Browsevignettes（“ CSAR”）

PDF	R脚本	CSAR VIGNETTE
PDF		参考手册

细节

生物浏览	chipseq，，，，遗传学，，，，软件，，，，转录
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 2.6（R-2.11）（6年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 2.15.0），iranges，，，，基因组机
进口	统计，utils
链接
建议	Shortread，，，，生物弦
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	狭窄
建议我	狭窄
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	csar_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	csar_1.12.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	csar_1.12.0.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/csar/tree/release-2.12
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/csar/
软件包下载报告	下载统计