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Bionet
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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅Bionet。
生物网络功能分析的常规
生物导体版本：2.12
该软件包为蛋白质 - 蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测提供了功能。可以通过将统计测试的p值分配给网络节点来集成到网络中。例如。从Affymetrix阵列的基因的差分表达获得的P值分配给网络节点。通过拟合β-均匀的混合模型并计算来自p值的得分，可以计算网络区域的整体得分，并且整数线性编程算法可以识别最大评分子网络。
作者：Marcus Dittrich和Daniela Beisser
维护者：marcus dittrich
引用（从r内，输入引用（“ Bionet”））：
安装
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文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Bionet”）
| R脚本 | Bionet教程 | |
| bum1.pdf | ||
| bum2.pdf | ||
| cytoscape.pdf | ||
| prec_recall_large.pdf | ||
| prec_recall_small.pdf | ||
| Tutorial-3DPlot.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，差异性，，，，基因表达，，，，GraphSandNetworks，，，，微阵列，，，，网络分析，，，，NetworkEnrichment，，，，软件 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.7（R-2.12）（5。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.10.0），生物酶，，，，图形，，，，rbgl |
| 进口 | Igraph0，AnnotationDbi |
| 链接 | |
| 建议 | RGL，，，，算，，，，DLBCL，，，，GeneFilter，，，，Xtable，，，，全部，，，，林玛，，，，HGU95AV2.DB，，，，XML |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | HTSANALYZER |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | Bionet_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bionet_1.18.0.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | Bionet_1.18.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/bionet/tree/release-2.12 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bionet/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
