安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815。
Bioconductor版本:2.11
SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP建造134。源数据文件用于这个包是由NCBI 8月15日,2011年,包含snp GRCh37.p2映射到参考基因组。警告:请注意,GRCh37。p2基因组的补丁版本GRCh37但补丁并不改变染色体22页,X, Y,太GRCh37本身是一样的hg19从UCSC基因组* *除了线粒体染色体。因此,单核苷酸多态性在这个包可以在BSgenome.Hsapiens.UCSC“注入”。hg19在正确的位置,他们将土地但这注入排除chrM(即序列将被注入无关)。
作者:Herve页面
维修工:h .页< hpages fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 0.99.6 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.10),IRanges,GenomicRanges |
进口 | 方法,IRanges,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | VariantAnnotation |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815_0.99.6.tar.gz |
Windows二进制 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815_0.99.6.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815/ |
包下载报告 | 下载数据 |