要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“topGO”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见topGO.
Bioconductor版本:2.11
topGO包提供了测试GO术语的工具,同时考虑GO图的拓扑结构。可以实现和应用不同的测试统计数据和消除GO术语之间的局部相似性和依赖性的不同方法。
作者:Adrian Alexa, Jorg Rahnenfuhrer
维护者:Adrian Alexa < Alexa at mpi-inf.mpg.de>
引文(从R内,输入引用(“topGO”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“topGO”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“topGO”)
R脚本 | topGO | |
topGO_classes_v3.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 2.10.0 |
在Bioconductor | BioC 2.0 (R-2.5)(9年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R(>= 2.10.0),方法,图(> = 1.14.0),Biobase(> = 2.0.0),GO.db(> = tripwire),AnnotationDbi(> = 1.7.19),SparseM(> = 0.73) |
进口 | 方法,图,Biobase,SparseM,AnnotationDbi,晶格 |
链接 | |
建议 | 所有,hgu95av2.db,hgu133a.db,genefilter,xtable,乘,Rgraphviz,globaltest |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | ccTutorial,RNAither |
进口我 | |
建议我 | 林格 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | topGO_2.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | topGO_2.10.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/topGO/tree/release-2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/topGO/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |