安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“simpleaffy”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

simpleaffy

这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅simpleaffy

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

Bioconductor版本:2.11

提供高级功能阅读Affy .CEL文件,表型数据,然后计算简单的事情,如t、褶皱等变化。使大量使用affy库。也有一些基本的散点图功能和机制生成高分辨率数字杂志……

作者:Crispin J·米勒

维护人员:Crispin米勒< cmiller在picr.man.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“simpleaffy”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“simpleaffy”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“simpleaffy”)

PDF QCandSimpleaffy.pdf
PDF R脚本 simpleaffy底漆
PDF 参考手册
文本 自述

细节

biocViews 注释,生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,转录,可视化
版本 2.34.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(> = 2.0.0)、方法、效用,grDevices,图形、统计,BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase,affy(> = 1.33.6),genefilter,gcrma
进口 方法、跑龙套grDevices、图形数据,BiocGenerics,Biobase,affy,genefilter,gcrma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
取决于我 yaqcaffy
进口我 affyQCReport,arrayMvout,arrayQualityMetrics
建议我 AffyExpress,ArrayTools
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 simpleaffy_2.34.0.tar.gz
Windows二进制 simpleaffy_2.34.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/simpleaffy/tree/release - 2.11
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/simpleaffy/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心