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siggenes
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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅siggenes。
多个测试使用萨姆和埃夫隆的经验贝叶斯方法
Bioconductor版本:2.11
识别差异表达基因和估计的错误发现率(罗斯福)使用微阵列(SAM)的意义分析和经验贝叶斯分析微阵列(EBAM)。
作者:Holger Schwender
维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >
从内部引用(R,回车引用(“siggenes”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“siggenes”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“siggenes”)
| R脚本 | siggenes手册 | |
| siggenesRnews.pdf | ||
| HTML | identify.sam.html | |
| HTML | plot.ebam.html | |
| HTML | plot.finda0.html | |
| HTML | plot.sam.html | |
| HTML | print.ebam.html | |
| HTML | print.finda0.html | |
| HTML | print.sam.html | |
| HTML | summary.ebam.html | |
| HTML | summary.sam.html | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,ExonArray,GeneExpression,微阵列,MultipleComparisons,单核苷酸多态性,软件 |
| 版本 | 1.32.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | 方法,Biobase,乘、样条函数、图形 |
| 进口 | stats4 |
| 链接 | |
| 建议 | affy,注释,genefilter,KernSmooth,scrime(> = 1.2.5) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | KCsmart,oneChannelGUI |
| 进口我 | 魅力,GeneSelector,minfi |
| 建议我 | GeneSelector,logicFS,XDE |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | siggenes_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | siggenes_1.32.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/siggenes/tree/release - 2.11 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
