# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“segmentSeq”)

这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅segmentSeq。

方法从高通量测序数据识别小RNA基因座

Bioconductor版本:2.11

高通量测序技术允许生产大量的短序列,可以对齐到基因组创建一组匹配的基因组。通过寻找的基因组区域密度较高的匹配,我们可以推断出一个细分的基因组生物学意义的地区。这个包中的方法允许从多个样本同时分割数据,考虑到复制数据,以创建一个共识分割。这有明显的应用程序的类测序实验,特别是在发现小RNA基因座和小说mRNA转录组的发现。

作者:Thomas j . Hardcastle

维护人员:托马斯·Hardcastle < tjh48在cam.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“segmentSeq”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“segmentSeq”)

PDF	R脚本	segmentSeq
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,HighThroughputSequencing,MultipleComparisons,软件
版本	1.10.1
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = tripwire)、方法baySeq(> = 1.11.1),ShortRead,GenomicRanges,IRanges
进口	baySeq、图形、grDevicesIRanges、方法、跑龙套GenomicRanges
链接
建议	雪
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	segmentSeq_1.10.1.tar.gz
Windows二进制	segmentSeq_1.10.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/segmentseq/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/segmentSeq/
包下载报告	下载数据