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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qpgraph。

逆向工程与qp-graphs的分子调控网络

Bioconductor版本:2.11

q-order偏相关图,简称qp-graphs,无向高斯图形马尔科夫模型由q-order部分相关性。他们是很有用的学习无向图形化高斯马尔可夫模型从数据集随机变量p的数量超过了可用的样本大小为n,例如,在微阵列数据的情况下,他们可以用来进行反向工程,生成分子调控网络。

作者:r . Castelo和a . Roverato

维护人员:罗伯特Castelo <罗伯特。在upf.edu castelo >

安装

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文档

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browseVignettes (“qpgraph”)

PDF		BasicUsersGuide.pdf
PDF	R脚本	逆向工程使用qpgraph转录调控网络
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneRegulation,GraphsAndNetworks,微阵列,NetworkInference,通路,软件,转录
版本	1.14.4
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(7年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.10),方法
进口	方法,注释,矩阵,图,Biobase,GGBase,AnnotationDbi
链接
建议	矩阵,mvtnorm,图,genefilter,类别,org.EcK12.eg.db,GOstats
SystemRequirements
增强了	rlecuyer,雪,Rgraphviz
URL	http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	qpgraph_1.14.4.tar.gz
Windows二进制	qpgraph_1.14.4.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/qpgraph/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/
包下载报告	下载数据