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- Bioconductor 2.11
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“predictionet”)
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predictionet
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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅predictionet。
推理预测网络设计(但不限于)基因组数据
Bioconductor版本:2.11
这个包包含一组相关功能网络推理结合基因组数据和之前信息提取生物医学文献和结构化生物数据库。主要功能是能够生成网络使用贝叶斯或回归推理方法;前者仅限于< 100的变量,后者可能推断网络与数以百计的变量。几个统计边缘和节点级别已经实现(边缘稳定性,预测能力的每个节点,…),以帮助用户关注高质量的子网。最终,这个包是用于预测网络的web应用程序开发的协作与Entagen dana - farber癌症研究所。
作者:本杰明·Haibe-Kains Catharina奥尔森,蒋禄卡波特米,约翰Quackenbush
维护人员:本杰明Haibe-Kains < bhaibeka jimmy.harvard.edu >, Catharina奥尔森< colsen在ulb.ac.be >
从内部引用(R,回车引用(“predictionet”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“predictionet”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“predictionet”)
| R脚本 | predictionet | |
| predictionet-boxplotr2pwcvfig2.pdf | ||
| predictionet-boxplotstabpwcvfig2.pdf | ||
| predictionet-cytoscape.pdf | ||
| predictionet-edgecoldiffig.pdf | ||
| predictionet-edgestabfig.pdf | ||
| predictionet-genepredabmccfig.pdf | ||
| predictionet-genepredabmcctestfig.pdf | ||
| predictionet-genepredabr2fig.pdf | ||
| predictionet-genepredabr2testfig.pdf | ||
| predictionet-pn_webapp_ras.pdf | ||
| predictionet-regnetcvpriorsweightfig2.pdf | ||
| predictionet-regnetcvtopo1topo2fig2.pdf | ||
| predictionet-regnetcvtopo1topo2predfig2.pdf | ||
| predictionet-regnetcvtopo1topo2stabfig2.pdf | ||
| predictionet-regrnet_design.pdf | ||
| predictionet-regrnetopofig.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 |
细节
| biocViews | GraphsAndNetworks,NetworkInference,软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | igraph0,catnet |
| 进口 | 处罚,RBGL,质量 |
| 链接 | |
| 建议 | 网络,minet,knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://compbio.dfci.harvard.eduhttp://www.ulb.ac.be/di/mlg |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | predictionet_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/predictionet/tree/release - 2.11 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/predictionet/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
