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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“nem”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见nem.
Bioconductor版本:2.11
包'nem'允许从扰动效应的嵌套结构中重建路径的特征。它将(1.)一组被扰动的通路成分作为输入,(2.)这些扰动的高维表型读数(例如基因表达、蛋白质表达)。输出是代表表型层次结构的有向图。
作者:Holger Froehlich, Florian Markowetz, Achim Tresch, Theresa Niederberger, Christian Bender, Matthias Maneck, Claudio Lottaz, Tim Beissbarth
维护者:Holger Froehlich
引文(从R内,输入引用(nem)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“nem”)
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browseVignettes (nem)
markowetz -论文- 2006. - pdf | ||
R脚本 | 嵌套效应模型——果蝇免疫反应的一个例子 | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,GraphsAndNetworks,微阵列,通路,软件 |
版本 | 2.34.0 |
在Bioconductor | BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.0),e1071(> = 1.5),图(> = 1.24),plotrix,limma,集群(> = 1.11),statmod,Hmisc,Rgraphviz |
进口 | 引导,e1071,图,图形,grDevices,方法,RBGL(> = 1.8.1),RColorBrewer,统计,utils,Rgraphviz |
链接 | |
建议 | Biobase(> = 1.10) |
SystemRequirements | |
增强了 | doMC,Rglpk |
URL | //www.anjoumacpherson.com |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | nem_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | nem_2.34.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/nem/tree/release-2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/nem/ |
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