安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“minfi”)
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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅minfi。
Bioconductor版本:2.11
分析和可视化工具Illumina公司的450 k数组数据
作者:丹尼尔•汉森Kasper马丁阿尔耶前来
维修工:Kasper丹尼尔·汉森< khansen jhsph.edu >
从内部引用(R,回车引用(“minfi”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“minfi”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“minfi”)
R脚本 | Minfi指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,DataImport,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),晶格,重塑,GenomicRanges,Biostrings,跑龙套 |
进口 | BiocGenerics,beanplot,RColorBrewer,nor1mix,siggenes,limma,preprocessCore,crlmm,matrixStats,mclust |
链接 | |
建议 | IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),minfiData(> = 0.2.0),RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | IlluminaHumanMethylation27kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kannotation.ilmn.v1.2,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,minfiData |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | minfi_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | minfi_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/minfi/tree/release - 2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/minfi/ |
包下载报告 | 下载数据 |