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甲基分析

此软件包适用于生物导体的2.11版;对于稳定的最新版本,请参阅甲基分析

DNA甲基化数据分析和可视化

生物导体版本:2.11

甲基分析套件旨在进行DNA甲基化数据分析和可视化。定义了一个新类,以将染色体位置信息与数据保持一致。该软件包的当前版本主要集中于分析Illumina Infinium甲基化阵列数据,但大多数方法可以推广到其他甲基化阵列或测序数据。

作者:Pan Du,Richard Bourgon

维护者:pan du

引用(从r内,输入引用(“甲基分析”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“甲基分析”)

PDF R脚本 甲基分析套件的介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(3。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10),网格,iranges,,,,生物酶(> = 2.5.5),org.hs.eg.db
进口 Lumi,,,,甲基菌,,,,GVIZ,,,,Genoset,,,,基因组机,,,,iranges,,,,rtracklayer,,,,GenomicFeatures,,,,注释,,,,生物酶(> = 2.5.5),AnnotationDbi,,,,GeneFilter,,,,Biomart, 方法
链接
建议 Illuminahumanmethylation450k.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Methyanalysis_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 Methyanalysis_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/methyanalysis/tree/release-2.11
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methyanalysis/
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