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在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的2.11版;对于稳定的最新版本,请参阅甲基分析。
生物导体版本:2.11
甲基分析套件旨在进行DNA甲基化数据分析和可视化。定义了一个新类,以将染色体位置信息与数据保持一致。该软件包的当前版本主要集中于分析Illumina Infinium甲基化阵列数据,但大多数方法可以推广到其他甲基化阵列或测序数据。
作者:Pan Du,Richard Bourgon
维护者:pan du
引用(从r内,输入引用(“甲基分析”)
):
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Browsevignettes(“甲基分析”)
R脚本 | 甲基分析套件的介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(3。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),网格,iranges,,,,生物酶(> = 2.5.5),org.hs.eg.db |
进口 | Lumi,,,,甲基菌,,,,GVIZ,,,,Genoset,,,,基因组机,,,,iranges,,,,rtracklayer,,,,GenomicFeatures,,,,注释,,,,生物酶(> = 2.5.5),AnnotationDbi,,,,GeneFilter,,,,Biomart, 方法 |
链接 | |
建议 | Illuminahumanmethylation450k.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Methyanalysis_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | Methyanalysis_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/methyanalysis/tree/release-2.11 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/methyanalysis/ |
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