要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htseqtools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

htseqtools

此软件包适用于生物导体的2.11版;对于稳定的最新版本,请参阅htseqtools

高通量测序数据的质量控制,可视化和处理

生物导体版本:2.11

我们为高通量测序(CHIP-SEQ,RNASEQ等)提供有效,易于使用的工具。其中包括MDS图(对PCA的类似物),检测效率低下的免疫沉淀或过度放大的工件,识别和测试具有大量读取的基因组区域的工具以及覆盖范围的可视化。

作者:Evarist Planet,Camille Stephan-Totto,Oscar Reina,Oscar Flores,David Rossell

维护者:Oscar Reina

引用(从r内,输入引用(“ htseqtools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htseqtools”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ htseqtools”)

PDF R脚本 htseqtools库的手册
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 高通量序列,,,,QualityControl,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.12.2),方法,生物基因(> = 0.1.0),生物酶,,,,iranges, 方法,大量的,,,,BSGENOME,,,,基因组机
进口
链接
建议
系统要求
增强 多核
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 htseqtools_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 htseqtools_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/htseqtools/tree/release-2.11
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/htseqtools/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心