要安装这个包,启动R并输入:

## #尝试http://如果https:// url不支持来源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("gene2pathway")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

gene2pathway

这个包是Bioconductor的2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参阅gene2pathway

基于互pro域签名预测单个基因的KEGG通路成员

Bioconductor版本:2.11

该软件包包含一个基因列表,并预测每个基因对应的KEGG通路。这是通过观察每个基因的互作用域来实现的。每个预测都有一个可信度评分。该软件包还可以预测信号通路中基因的连接成分。KEGG支持的每种生物的单独模型可以训练。

作者:Holger Froehlich

维护程序:Holger Froehlich

引用(从R中,输入引用(“gene2pathway”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

## #尝试http://如果https:// url不支持来源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("gene2pathway")

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档,启动R并输入:

browseVignettes(“gene2pathway”)

PDF R脚本 gene2pathway
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类,GraphsAndNetworks,微阵列,NetworkEnrichment,通路,软件
版本 2.12.0
Bioconductor自 BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.10.0),kernlab(> = 0.9),biomaRt(> = 1.12.1),KEGGSOAP(> = 1.12.0),RBGL,AnnotationDbi,org.Dm.eg.db,keggorthology(> = 2.0)
进口 SSOAP,RCurl
链接
建议
SystemRequirements
增强了 doMC
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在你的R会话中使用这个包的说明。

包的来源 gene2pathway_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 gene2pathway_2.12.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/gene2pathway/tree/release-2.11
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gene2pathway/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-有关生物导体包装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心