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此软件包适用于生物导体的2.11版；对于稳定的最新版本，请参阅fastseg。

FastSeg-快速分割算法

生物导体版本：2.11

FastSeg实现了非常快速有效的分割算法。它具有与DNACOPY相似的功能（Olshen和Venkatraman 2004），但更快，更灵活。FastSeg可以从DNA微阵列和下一代测序中的数据分割数据，例如检测副本编号段。此外，它可以从RNA微阵列（例如瓷砖阵列）分割数据以识别成绩单。通常，它可以将给出的数据分割为矩阵或向量。各种数据格式可以用作fastSeg的输入，例如用于微阵列的表达式设置对象或用于测序数据的granges。FASTSEG的分割标准基于贝叶斯框架中的统计检验，即网络t检验（Baldi 2001）。速度是由于事实引起的，即FastSeg不需要采样，并且使用动态编程方法来计算片段的第一和更高阶段。

作者：Guenter Klambauer

维护者：Guenter Klambauer

安装

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文档

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browsevignettes（“ fastseg”）

PDF	R脚本	FastSeg：R包的手册
PDF		参考手册

细节

生物浏览	分类，，，，库务，，，，软件
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（4。5年）
执照	LGPL（> = 2.0）
要看	r（> = 2.13），基因组机，，，，生物酶
进口	图形，统计信息，iranges，，，，生物基因
链接
建议	DNACOPIGY，，，，奥利戈
系统要求
增强
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/fastseg/fastseg.html
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	fastSeg_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	fastSeg_1.4.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/fastseg/tree/release-2.11
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/fastseg/
软件包下载报告	下载统计