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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cn.farms。

cn.farms- Factor Analysis for copy number estimation

Bioconductor版本:2.11

这个包实现了cn。农场拷贝数变异(CNV)算法分析。cn。农场可以分析最常见Affymetrix (250 k-snp6.0)数组类型,支持使用雪和ff高性能计算。

作者:Andreas Mitterecker Djork-Arne Clevert

维护人员:Andreas Mitterecker < Mitterecker在bioinf.jku.at >

安装

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文档

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browseVignettes (“cn.farms”)

PDF	R脚本	cn.farms: Manual for the R package
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,CopyNumberVariants,微阵列,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 2.11),Biobase、方法、ff,oligoClasses,降雪
进口	DBI,affxparser,益生元,DNAcopy,preprocessCore,晶格
链接
建议	pd.mapping250k.sty,pd.mapping250k.nsp,pd.genomewidesnp.5,pd.genomewidesnp.6
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	cn.farms_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	cn.farms_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/cn.farms/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/
包下载报告	下载数据