要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“clusterProfiler”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见clusterProfiler.
Bioconductor版本:2.11
该软件包实现了分析和可视化基因和基因簇的功能配置文件(GO和KEGG)的方法。
作者:余光创,王立根
维护人员:guangchuangyu
引文(从R内,输入引用(“clusterProfiler”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“clusterProfiler”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“clusterProfiler”)
R脚本 | clusterProfiler简介 | |
clusterProfiler_for_unsupported_organism.pdf | ||
omics2012.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,去,GeneSetEnrichment,MultipleComparisons,通路,软件,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),ggplot2 |
进口 | 方法、stats4DBI,plyr,AnnotationDbi,GO.db,KEGG.db,org.Hs.eg.db,剂量 |
链接 | |
建议 | GOSemSim,ReactomePA |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/omi.2011.0118 |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 剂量,GOSemSim,ReactomePA |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | clusterProfiler_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | clusterProfiler_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/clusterProfiler/tree/release-2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/clusterProfiler/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |