要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“clusterProfiler”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

clusterProfiler

此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见clusterProfiler

基因和基因簇功能谱的统计分析和可视化

Bioconductor版本:2.11

该软件包实现了分析和可视化基因和基因簇的功能配置文件(GO和KEGG)的方法。

作者:余光创,王立根

维护人员:guangchuangyu

引文(从R内,输入引用(“clusterProfiler”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“clusterProfiler”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“clusterProfiler”)

PDF R脚本 clusterProfiler简介
PDF clusterProfiler_for_unsupported_organism.pdf
PDF omics2012.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneSetEnrichmentMultipleComparisons通路软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),ggplot2
进口 方法、stats4DBIplyrAnnotationDbiGO.dbKEGG.dborg.Hs.eg.db剂量
链接
建议 GOSemSimReactomePA
SystemRequirements
增强了
URL http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/omi.2011.0118
全靠我
进口我
建议我 剂量GOSemSimReactomePA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 clusterProfiler_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 clusterProfiler_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/clusterProfiler/tree/release-2.11
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/clusterProfiler/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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