要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cellHTS2”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见cellHTS2.
Bioconductor版本:2.11
该软件包为384孔微量滴定板(或类似)格式的高通量分析提供了分析工具。功能包括数据导入和管理、规范化、质量评估、复制摘要和统计评分。生成一个网页,提供数据和分析结果的详细图形概述。在我们的工作中,我们已经将该包应用于苍蝇和人类细胞的RNAi筛选,以及酵母文库的筛选。参见?cellHTS2获得简要介绍。
作者:Ligia Bras, Wolfgang Huber
维护者:Joseph Barry < Joseph。Barry在embl.de>
引文(从R内,输入引用(“cellHTS2”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cellHTS2”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“cellHTS2”)
R脚本 | 主要插图(完整版本):基于单元格的屏幕的端到端分析 | |
R脚本 | 主要插图:基于单元的屏幕的端到端分析 | |
R脚本 | 补充:增强-抑制筛选 | |
R脚本 | 补充:多通道测定 | |
参考手册 |
biocViews | CellBasedAssays,预处理,软件,可视化 |
版本 | 2.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),RColorBrewer,Biobase、方法、genefilter,splots,vsn,hwriter,locfit、网格 |
进口 | 普拉达,GSEABase,类别, stats4 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber |
全靠我 | coRNAi,imageHTS,staRank |
进口我 | HTSanalyzeR,RNAinteract |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | cellHTS2_2.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | cellHTS2_2.22.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/cellHTS2/tree/release-2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cellHTS2/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |