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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biomaRt。

接口BioMart数据库(例如运用,宇宙,Wormbase和Gramene)

Bioconductor版本:2.11

近年来大量的生物数据变得可用的公共数据存储库。容易获得这些宝贵的数据资源和公司集成与数据分析需要综合生物信息学数据分析。biomaRt提供了一个接口的数据库实现biomaRt软件套件(http://www.biomart.org)。包使检索大量的数据以统一的方式,而不需要了解底层数据库模式或写复杂的SQL查询。BioMart数据库是运用的例子,宇宙,Uniprot, HGNC, Gramene, Wormbase dbSNP映射到运用。这些主要的数据库给biomaRt用户直接访问一组不同的数据,使各种强大的在线查询从基因注释数据库挖掘。

作者:史蒂芬Durinck < sdurinck gmail.com >,沃尔夫冈·胡贝尔<胡贝尔在ebi.ac.uk >

维护人员:史蒂芬Durinck < sdurinck gmail.com >

安装

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文档

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PDF	R脚本	biomaRt用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,软件
版本	2.14.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	跑龙套,XML,RCurl
链接
建议	注释
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ChIPpeakAnno,domainsignatures,easyRNASeq,gene2pathway,genefu,GenomeGraphs,VegaMC
进口我	affycoretools,ArrayExpressHTS,ChIPpeakAnno,DEXSeq,GenomicFeatures,Gviz,HTSanalyzeR,IdMappingRetrieval,methyAnalysis,phenoTest,R453Plus1Toolbox,RNAither
建议我	BiocCaseStudies,ccTutorial,GeneAnswers,GenomicFeatures,Genominator,等压线,leeBamViews,时间的,海市蜃楼,oneChannelGUI,Rcade,RnaSeqTutorial,ShortRead,SIM卡
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	biomaRt_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	biomaRt_2.14.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/biomart/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biomaRt/
包下载报告	下载数据