要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“arrayQualityMetrics”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见arrayQualityMetrics.
Bioconductor版本:2.11
这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。报告包含一般和特定于平台的部分。支持单色和双色阵列平台。
作者:奥黛丽·考夫曼,沃尔夫冈·胡贝尔
维护者:Audrey Kauffmann
引文(从R内,输入引用(“arrayQualityMetrics”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“arrayQualityMetrics”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)
R脚本 | 高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理 | |
R脚本 | 简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,ReportWriting,软件,TwoChannel |
版本 | 3.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | affy,affyPLM(> = 1.27.3),beadarray,Biobase,开罗(> = 1.4 6),genefilter,图形,grDevices,网格,Hmisc,hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、RColorBrewer,setRNG,simpleaffy,属性,SVGAnnotation (>= 0.9-0), utils,vsn(> = 3.23.3),XML |
链接 | |
建议 | ALLMLL,亚兰 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | arrayQualityMetrics_3.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | arrayQualityMetrics_3.14.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/arrayQualityMetrics/tree/release-2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |