安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“affyPLM”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affyPLM。
Bioconductor版本:2.11
一个包扩展,提高基地affy包的功能。例程,使大量使用编译后的代码的速度。中央的重点是实现方法拟合probe-level模型和工具使用这些模型。基于PLM的质量评估工具。
作者:本Bolstad < bmb bmbolstad.com >
维护人员:本Bolstad < bmb bmbolstad.com >
从内部引用(R,回车引用(“affyPLM”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“affyPLM”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“affyPLM”)
R脚本 | affyPLM:先进MAplot函数的使用 | |
R脚本 | affyPLM:拟合调查水平模型 | |
R脚本 | affyPLM:基于模型的质量控制评估Affymetrix GeneChips | |
R脚本 | affyPLM: threestep函数 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件 |
版本 | 1.34.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),affy(> = 1.11.0),Biobase(> = 2.17.8),gcrma统计数据,preprocessCore(> = 1.5.1) |
进口 | BiocGenerics,zlibbioc、图形grDevices、方法 |
链接 | preprocessCore |
建议 | affydata,质量 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://bmbolstad.com |
取决于我 | RefPlus |
进口我 | affyQCReport,arrayQualityMetrics,virtualArray |
建议我 | AffyExpress,affylmGUI,arrayMvout,ArrayTools,BiocCaseStudies,BiocGenerics,frmaTools,ggbio,metahdep,oneChannelGUI |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | affyPLM_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyPLM_1.34.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/affyplm/tree/release - 2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affyPLM/ |
包下载报告 | 下载数据 |