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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅VanillaICE。

高通量基因序列的隐马尔可夫模型

Bioconductor版本:2.11

隐马尔可夫模型描述染色体改变的高吞吐量SNP数组

作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >,凯文•Scharpf和Ingo Ruczinski < Ingo jhsph.edu >

维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >

安装

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文档

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PDF	R脚本	crlmmDownstream
PDF	R脚本	VanillaICE装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,CopyNumberVariants,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本	1.20.3
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(8.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 2.14.0)
进口	统计,跑龙套、方法Biobase,oligoClasses(> = 1.19.36),晶格,IRanges(> = 1.13.22)、网格二甲基砜,crlmm,foreach,GenomicRanges,matrixStats
链接
建议	genomewidesnp6Crlmm,hapmapsnp6,RColorBrewer,genefilter,RSQLite,foreach,RUnit,pd.mapping50k.hind240,SNPchip(> = 2.2.0)
SystemRequirements
增强了	DNAcopy,crlmm
URL
取决于我
进口我	MinimumDistance
建议我	oligoClasses
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	VanillaICE_1.20.3.tar.gz
Windows二进制	VanillaICE_1.20.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/vanillaice/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/VanillaICE/
包下载报告	下载数据