# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ShortRead”)

这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ShortRead。

高通量测序短内容数据的类和方法。

Bioconductor版本:2.11

基类、函数和高通量的方法表示,短内容测序数据。

作者:马丁·摩根,迈克尔·劳伦斯,西蒙安德斯

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ShortRead”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ShortRead”)

PDF	R脚本	介绍ShortRead
PDF		ShortRead_and_HilbertVis.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,HighThroughputSequencing,质量控制,测序,软件
版本	1.16.4
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.4),GenomicRanges(> = 1.7.43),Biostrings(> = 2.25.6),晶格,Rsamtools(> = 1.7.42),latticeExtra
进口	BiocGenerics,IRanges,GenomicRanges,Biostrings,Biobase,hwriter,Rsamtools,zlibbioc,晶格
链接	IRanges,Biostrings
建议	biomaRt,RUnit,GenomicFeatures,yeastNagalakshmi
SystemRequirements
增强了	Rmpi、并行
URL
取决于我	chipseq,ChIPseqR,easyRNASeq,EatonEtAlChIPseq,EDASeq,girafe,HTSeqGenie,诊断,OTUbase,r3Cseq,Rolexa,rSFFreader,segmentSeq
进口我	ArrayExpressHTS,chipseq,ChIPseqR,ChIPsim,HiTC,诊断,OTUbase,R453Plus1Toolbox,Rolexa,rSFFreader
建议我	CSAR,DBChIP,Genominator,图片,平,R453Plus1Toolbox,Repitools,RnaSeqTutorial,Rsamtools,yeastRNASeq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ShortRead_1.16.4.tar.gz
Windows二进制	ShortRead_1.16.4.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/shortread/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ShortRead/
包下载报告	下载数据