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此软件包适用于生物导体的2.11版；对于稳定的最新版本，请参阅Sradb。

NCBI SRA和工具的元数据汇编

生物导体版本：2.11

序列读取存档（SRA）是下一代测序平台的测序数据最大的公共存储库，包括Roche 454 GS系统，Illumina Genome Genome Analyzer，Applied Biosystems solid System，Helicos Heliscope等。但是，使用当前工具找到感兴趣的数据可能会具有挑战性。SRADB试图访问与提交，研究，样本，实验和运行更可行的元数据。这是通过将所有NCBI SRA元数据解析为可以在本地存储和查询的SQLite数据库来完成的。包装中的FullText搜索使查询元数据非常灵活且功能强大。可以下载SRA或SRA-Lite文件以在本地进行对齐。随着新数据添加到SRA，可以定期更新SQLITE数据库，并且可以随意下载最新的元数据。

作者：杰克·朱和肖恩·戴维斯

维护者：jack zhu

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Sradb”）

PDF	R脚本	使用sradb查询序列读取存档
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，高通量序列，，，，基础设施，，，，软件
版本	1.12.1
在生物导体中	Bioc 2.6（R-2.11）（6年）
执照	艺术2.0
要看	rsqlite（> = 0.8-4），图形，，，，rcurl
进口	地球
链接
建议	rgraphviz
系统要求
增强
URL	http://watson.nci.nih.gov/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	sradb_1.12.1.tar.gz
Windows二进制	sradb_1.12.1.zip
Mac OS X 10.6（雪豹）
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/sradb/tree/release-2.11
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/sradb/
软件包下载报告	下载统计