安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

SNPchip

这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPchip

可视化的拷贝数变化

Bioconductor版本:2.11

这个包定义了高通量基因组数据的可视化方法

作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >和Ingo Ruczinski

维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >

从内部引用(R,回车引用(“SNPchip”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SNPchip”)

PDF R脚本 绘制染色体组型
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariants,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本 测试盒框
Bioconductor自 BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.14.0)
进口 图形,晶格、网格foreach、跑龙套、方法oligoClasses(> = 1.19.30),Biobase,GenomicRanges
链接
建议 crlmm,IRanges,RUnit
SystemRequirements
增强了 doSNOW,VanillaICE,RColorBrewer
URL http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html
取决于我 mBPCR
进口我 crlmm,MinimumDistance,phenoTest
建议我 类别,oligoClasses,VanillaICE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 SNPchip_2.4.0.tar.gz
Windows二进制 SNPchip_2.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/snpchip/tree/release - 2.11
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心