安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPchip。
Bioconductor版本:2.11
这个包定义了高通量基因组数据的可视化方法
作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >和Ingo Ruczinski
维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SNPchip”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SNPchip”)
R脚本 | 绘制染色体组型 | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariants,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
版本 | 测试盒框 |
Bioconductor自 | BioC 2.0 (r - 2.5)(9年) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.14.0) |
进口 | 图形,晶格、网格foreach、跑龙套、方法oligoClasses(> = 1.19.30),Biobase,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | crlmm,IRanges,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | doSNOW,VanillaICE,RColorBrewer |
URL | http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html |
取决于我 | mBPCR |
进口我 | crlmm,MinimumDistance,phenoTest |
建议我 | 类别,oligoClasses,VanillaICE |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | SNPchip_2.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | SNPchip_2.4.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/snpchip/tree/release - 2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/ |
包下载报告 | 下载数据 |