要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MinimumDistance.
Bioconductor版本:2.11
基于高维基因分型平台的三组从头拷贝数变异分析
作者:Robert B Scharpf, Moiz Bootwalla, Ingo Ruczinski
维护者:Robert B Scharpf
引文(从R内,输入引用(“MinimumDistance”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MinimumDistance”)
R脚本 | 检测病例-亲本三人组中从头拷贝数的改变 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,CopyNumberVariants,微阵列,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.2.4 |
在Bioconductor | BioC 2.10 (R-2.15)(4年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.14),BiocGenerics(> = 0.3.2),IRanges(> = 1.13.30) |
进口 | 方法,DNAcopy跑龙套,二甲基砜,晶格,BiocGenerics,VanillaICE(> = 1.19.23),ff,SNPchip(> = 2.3.10),Biobase(> = 2.17.8),foreach,oligoClasses(> = 1.19.34),GenomicRanges |
链接 | |
建议 | human610quadv1bCrlmm,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | 雪,doSNOW |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | MinimumDistance_1.2.4.tar.gz |
Windows二进制 | MinimumDistance_1.2.4.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MinimumDistance/tree/release-2.11 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |