要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Kegggraph”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于生物体的2.11版;对于稳定的最新版本版本,请参阅keggraph.。
Bioconductor版本:2.11
Kegggraph是Kegg Pathway和Graph对象之间的接口以及分析,解剖和可视化这些图形的一个工具。它将定期更新的KGML(KEGG XML)文件解析为维护所有基本途径属性的图形模型。该包提供功能,包括解析,图形操作,可视化等。
作者:Jitao David张
维护者:jitao david zhang
引文(从R内,输入引文(“kegggraph”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Kegggraph”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“Kegggraph”)
PDF. | r script. | Kegggraph:应用程序示例 |
PDF. | r script. | Kegggraph:Groog Pathway的图表方法 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | graphsandnetworks.那NetworkVisualization.那途径那软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.4(R-2.9)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 2.10),方法,XML.(> = 2.3-0),图形 |
进口 | 方法,XML.那图形 |
链接到 | |
建议 | rghrachviz那RBGL.那运行那rcolorbrewer.那kegg.db.那org.hs.eg.db.那hgu133plus2.db.那斯维亚 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://www.nextbiomotif.com. |
取决于我 | |
进口我 | 缩影那ncigraph. |
建议我 | 缩影那斯维亚 |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | kegggraph_1.14.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | kegggraph_1.14.0.zip. |
Mac OS x 10.6(雪豹) | |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/keggraph/tree/release-2.11. |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/keggraph/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |