##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Gviz”)

此包适用于Bioconductor 2.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Gviz．

沿着基因组坐标绘制数据和注释信息

Bioconductor版本:2.11

基因组数据分析需要已知基因组信息和新的实验数据的集成可视化。Gviz使用biomaRt和rtracklayer包对Ensembl和UCSC执行实时注释查询，并将其转换为网格图形包的视口中的基因/转录本结构。这将导致基因组信息与您的数据一起绘制。

作者:Florian Hahne, Steffen Durinck, Robert Ivanek, Arne Mueller, Steve Lianoglou>

维护者:Florian Hahne < Florian。Hahne在novarti.com >

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Gviz”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Gviz”)

PDF	R脚本	Gviz用户指南
PDF		ucsc1.pdf
PDF		ucsc2.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，软件，可视化
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10.0)，方法，网格
进口	IRanges(> = 1.13.19),rtracklayer(> = 1.15.5),晶格，RColorBrewer，biomaRt(> = 2.11.0),GenomicRanges(> = 1.7.14),AnnotationDbi(> = 1.17.11),Biobase(> = 2.15.3),BiocGenerics(> = 0.1.4),GenomicFeatures(> = 1.9.7),BSgenome(> = 1.25.1),Biostrings(> = 2.25.1),biovizBase(> = 1.5.7)
链接
建议	xtable，GenomicFeatures，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	腰带
进口我	methyAnalysis，平
建议我	gwascat
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	Gviz_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	Gviz_1.2.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/Gviz/tree/release-2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Gviz/
软件包下载报告	下载数据