安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

GOSemSim

这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOSemSim

GO-terms语义相似性度量

Bioconductor版本:2.11

蕾斯尼克提出的五个方法实现,Schlicker江,林和王分别估算语义相似之处。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,狗,鸡,黑猩猩,Coelicolor,大肠杆菌菌株K12的酒井法子,飞翔,人类,疟疾,鼠,猪,猴,鼠,蠕虫,非洲爪蟾蜍,酵母,斑马鱼。

作者:Guangchuang余

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GOSemSim”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 介绍GOSemSim
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类,,NetworkAnalysis,通路,软件
版本 1.16.1
Bioconductor自 BioC 2.4 (r - 2.9)(7年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 2.10),Rcpp
进口 方法,AnnotationDbi,GO.db,org.Hs.eg.db
链接 Rcpp
建议 剂量,clusterProfiler
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/26/7/976.full
取决于我
进口我 剂量
建议我 clusterProfiler,ReactomePA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GOSemSim_1.16.1.tar.gz
Windows二进制 GOSemSim_1.16.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/gosemsim/tree/release - 2.11
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心