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这个包是2.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GEOquery。

从NCBI基因表达综合(GEO)获得数据

Bioconductor版本:2.11

NCBI基因表达综合(GEO)是一个公共存储库的微阵列数据。鉴于该资源丰富多变的本性,它只是自然要BioConductor工具应用到这些数据。GEOquery是地理和BioConductor之间的桥梁。

作者:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

维护人员:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

安装

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文档

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PDF	R脚本	GEOquery
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,微阵列,OneChannel,圣人,软件,TwoChannel
版本	2.24.1
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(10年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,Biobase
进口	XML,RCurl
链接
建议	limma,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	http://watson.nci.nih.gov/ sdavis
取决于我	dyebiasexamples,GEOmetadb
进口我	BeadArrayUseCases,ChIPXpress,SRAdb,virtualArray
建议我	dyebias,GeneExpressionSignature,PGSEA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GEOquery_2.24.1.tar.gz
Windows二进制	GEOquery_2.24.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/geoquery/tree/release - 2.11
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GEOquery/
包下载报告	下载数据