要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ arrayexpresshts”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

arrayexpresshts

此软件包适用于生物导体的2.11版;对于稳定的最新版本,请参阅arrayexpresshts

ArrayExpress高吞吐量测序处理管道

生物导体版本:2.11

用于公共阵列Express实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道

作者:安吉拉·冈卡维斯(Angela Goncalves),安德鲁·蒂科诺夫(Andrew Tikhonov)

维护者:Angela Goncalves ,Andrew Tikhonov

引用(从r内,输入引用(“ arrayexpresshts”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ arrayexpresshts”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ arrayexpresshts”)

PDF R脚本 ArrayExpresshts:用于转录分析实验的RNA-SEQ管道
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 高通量序列,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(5年)
执照 艺术许可2.0
要看 采样,,,,rsamtools(> = 1.3.32),
进口 生物酶,,,,生物弦,,,,deseq,,,,基因组机,,,,HMISC,,,,iranges,,,,R2HTML,,,,rcolorbrewer,,,,rsamtools,,,,Shortread,,,,XML,,,,Biomart,,,,EDGER,grdevices,图形,方法,rjava,统计SVMISC,UTILS
链接 rsamtools
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 arrayexpresshts_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/arrayexpresshts/tree/release-2.11
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayexpresshts/
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