要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“leeBamViews”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见leeBamViews.
Bioconductor版本:2.10
数据来自midid 19096707;用于管理多个NGS样本的原型
作者:VJ Carey
维护者:VJ Carey
引文(从R内,输入引用(“leeBamViews”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“leeBamViews”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“leeBamViews”)
使用bamViews管理多个NGS样本 | ||
参考手册 |
biocViews | CellBiology,DifferentialExpression,ExperimentData,遗传学,HighThroughputSequencing,RNAseq,RNAseqData |
版本 | 0.99.19 |
许可证 | 艺术2.0 |
取决于 | R (>= 2.15.0),Biobase,Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome |
进口 | GenomicRanges、方法 |
链接 | |
建议 | GenomeGraphs,biomaRt,org.Sc.sgd.db,刨边机 |
SystemRequirements | |
增强了 | 多核 |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | EDASeq,GenomicRanges |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | leeBamViews_0.99.19.tar.gz |
Windows二进制 | leeBamViews_0.99.19.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/leeBamViews/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |