要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427.
Bioconductor版本:2.10
从dbSNP BUILD 131:human_9606中提取的智人SNP位点和等位基因(基于GRCh37)用于此包的源数据文件由NCBI于2010年3月24日至26日创建。警告:本包中的snp基于GRCh37基因组。请注意,除了线粒体染色体外,GRCh37基因组与UCSC的hg19基因组相同。因此,该包中的snp可以被“注入”到bsgenome . hspiens . ucsc中。hg19,但此注射将排除chrM(即不会以该序列注射任何东西)。
作者:Herve Pages
维护:H. Pages
引文(从R内,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427”)
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens |
版本 | 0.99.6 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),IRanges,GenomicRanges |
进口 | 方法,IRanges,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | BSgenome,cheung2010 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427_0.99.6.tar.gz |
Windows二进制 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427_0.99.6.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427/ |
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