注意,这个分支的新闻项目是相当有限的。这是经过设计的,因为这个分支代表了Bioconductor上的“稳定版本”,这意味着仅对1.0进行了关键的错误修复。Z“稳定”版本发布后。在1.1上进行了更多的开发。z“开发分支”,它在GitHub上是实时和增量发布的,在Bioconductor上的devel链接上更加交错。请参阅GitHub网站上的官方安装说明,以获取和安装您所选择的口味的详细信息:https://github.com/joey711/phyloseq/wiki/Installation phyloseq 0.99。x =========== * Bioconductor开发版本更新。* BIOM格式导入:import_biom()函数*并行快速UniFrac *距离()包装生态距离计算*纵坐标()包装,计算许多不同的排序方法。* plot_ordination()强大,灵活的排序绘图使用ggplot2 * make_sample_network(), plot_sample_network() -微生物组网络可视化* plot_richness_estimates()简单,灵活的总结物种丰富度*支持双原则坐标分析(DPCoA) *几个已发布的示例数据集包括*通用导入所有支持的数据格式:import() *大量文档更新。*大量的修复和改进。phyloseq 1.0.3 =========== -修复从更新到ggplot2 0.9.2 0.9.2+现在需要的ggplot2兼容性问题。phyloseq 1.0.2 =========== -修复了一个源于铭文更新的铭文兼容性问题。 igraph dependency changed to igraph0