版本1.13的变化-----------------------新功能解析广泛的基因集子类别。用户可见的重大变化一个特殊标识符取代了基于ruuid的标识符。在1.5版的变化----------------------重要的用户可见的变化构造函数类EntrezIdentifier，酶标识符，GenenameIdentifier, RefseqIdentifier, SymbolIdentifier, UnigeneIdentifier现在可以接受一个'annotation'参数。这用于指示标识符来自哪个注释包，例如，EntrezIdentifier("hgu95av2.db")表示EntrezId来自hgu95av2.db包。o GOCollection现在跟踪本体以及证据码。o添加ComputedCollection类来描述计算产生的基因集集合。o添加用于读取OBO基因集的OBOCollection类，包括从互联网检索OBO集合的函数(getOBOCollectoin)，以及将OBOCollections转换为graphNEL对象。o从GOCollections构造的GeneSets需要一个具有适当(即GO到标识符)映射的geneIdType，例如，geneIdType=EntrezIdentifier("org.Hs.eg.db")新特征o geneIdType<-和mapIdentifiers现在可以在注释包中的任何两个标识符类型之间映射，例如，SymbolIdentifer('org.Hs.eg.db')到GenenameIdentifier('org.Hs.eg.db') o解析修订的广义基因集。o在一些“显示”方法中增加了更广泛的信息，以允许映射用户提供的AnnDbBimap对象的mapIdentifiers方法。BUG修复o GO evidenceCodes更新为当前可用的代码，如在GO o GeneSetCollection,ExpressionSet，(Pfam|Prosite|Chrloc)Collection-method现在正确导航底层注释并创建基因集集合。o将AnnotationIdentifier映射到AnnotationIdentifier由于方法选择错误而失败(开始日期:2008年2月9日)