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这个包是2.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见tilingArray．

转录本定位与高密度寡核苷酸贴片阵列

Bioconductor版本:2.10

该包提供的功能可以用于高密度贴片微阵列数据(如Affymetrix基因芯片)的分析，以测量转录本的丰度和结构。该包的主要功能有:1。用于表示线性数据序列的分割的类“分割”;2.用动态规划算法拟合分段常数模型的函数“分段”，既快速又精确;3.用结构变更包计算置信区间的函数'confint';4.函数'plotAlongChrom'用于生成漂亮的图;5. the function 'normalizeByReference' for probe-sequence dependent response adjustment from a (set of) reference hybridizations.

作者:Wolfgang Huber, Zhenyu Xu, Joern Toedling, Matt Ritchie贡献

维护者:徐振宇<振宇在ebi.ac.uk>

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tilingArray”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tilingArray”)

PDF		plotAlongChrom函数介绍
PDF		介绍使用分段函数拟合一个分段常数曲线
PDF		使用tilingArray包中的normalizeByReference函数进行正常化
PDF		分割演示
PDF		补充。成本矩阵的计算
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，预处理，软件，可视化
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.11.0),Biobase、方法、象图
进口	strucchange，affy，vsn，genefilter，RColorBrewer、网格stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ADaCGH2，davidTiling
进口我	snapCGH
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	tilingArray_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	tilingArray_1.34.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/tilingArray/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tilingArray/
包下载报告	下载数据