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此软件包适用于生物导体的2.10版;对于稳定的最新版本,请参阅蒂格。
生物导体版本:2.10
Tigre软件包实现了我们的高斯过程微分方程模型的方法,用于分析单个输入基序网络的基因表达时间序列。该软件包可用于从已知靶基因的表达测量中推断出未观察到的转录因子(TF)蛋白浓度,或对TF的候选靶标进行排名。
作者:Antti Honkela,Pei Gao,Jonatan Ropponen,Miika-Petteri Matikainen,Magnus Rattray,Neil D. Lawrence
维护者:athti honkela
引用(从r内,输入引用(“ Tigre”)
):
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Browsevignettes(“ Tigre”)
Tigre快速指南 | ||
Tigre用户指南 | ||
tigre-009.pdf | ||
Tigre-010.pdf | ||
Tigre-011.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,软件,,,,时间科,,,,转录 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.6(R-2.11)(6年) |
执照 | AGPL-3 |
要看 | r(> = 2.11.0),生物基因,,,,生物酶 |
进口 | 方法,生物基因,,,,生物酶,,,,AnnotationDbi,,,,GPLOTS,图形,彪马,统计,utils,注释,,,,DBI,,,,rsqlite |
链接 | |
建议 | 彪马,,,,drosgenome1.db,,,,注释,,,,Lumi |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.bioinf.manchester.ac.uk/resources/tiger/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | tigre_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | tigre_1.10.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/tigre/tree/release-2.10 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tigre/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |