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此包适用于Bioconductor 2.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见segmentSeq．

从高通量测序数据中识别小RNA位点的方法

Bioconductor版本:2.10

高通量测序技术允许生产大量的短序列，这些短序列可以与基因组对齐，以创建一组与基因组匹配的序列。通过寻找基因组中有高密度匹配的区域，我们可以推断出基因组的分割为具有生物学意义的区域。这个包中的方法允许同时分割来自多个样本的数据，考虑到复制数据，以创建一个一致的分割。这在许多类型的测序实验中有明显的应用，特别是在小RNA位点的发现和新的mRNA转录组的发现方面。

作者:Thomas J. Hardcastle

维护者:Thomas J. Hardcastle

安装

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文档

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browseVignettes(“segmentSeq”)

PDF		segmentSeq
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学，HighThroughputSequencing，MultipleComparisons，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 2.3.0)，方法，baySeq(> = 1.8.1),ShortRead，GenomicRanges，IRanges
进口	baySeq，图形，grDevices，IRanges，方法，utils，GenomicRanges
链接
建议	雪
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	segmentSeq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	segmentSeq_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/segmentSeq/tree/release-2.10
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/segmentSeq/
软件包下载报告	下载数据